Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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SH3BP4Q9P0V3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
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SH3BP4Q9P0V3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4Q9P0V3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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