Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TVP23BQ9NYZ1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23BQ9NYZ1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms