Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIS18AQ9NYP9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms