Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBA8Q9NY65 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms