Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC28Q9NX36 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms