Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD8Q9NX08 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COMMD8Q9NX08 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180 ms