Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSBQ9NSD9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms