Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC6A13Q9NSD5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms