Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms