Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TM7SF3Q9NS93 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TM7SF3Q9NS93 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms