Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KCNIP2Q9NS61 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms