Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRN4Q9NRL3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms