Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms