Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPS4Q9NQG7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS4Q9NQG7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS4Q9NQG7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS4Q9NQG7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS4Q9NQG7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS4Q9NQG7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS4Q9NQG7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS4Q9NQG7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS4Q9NQG7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS4Q9NQG7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS4Q9NQG7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS4Q9NQG7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS4Q9NQG7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS4Q9NQG7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS4Q9NQG7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPS4Q9NQG7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms