Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTAC1Q9NQ79 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTAC1Q9NQ79 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTAC1Q9NQ79 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTAC1Q9NQ79 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTAC1Q9NQ79 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTAC1Q9NQ79 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTAC1Q9NQ79 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTAC1Q9NQ79 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTAC1Q9NQ79 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTAC1Q9NQ79 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms