Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
LHX9Q9NQ69 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms