Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP4F12Q9HCS2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.1 ms