Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms