Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY9Q9HBG7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms