Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C5orf42Q9H799 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms