Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2D4AQ9H788 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2D4AQ9H788 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2D4AQ9H788 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2D4AQ9H788 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2D4AQ9H788 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms