Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRN3Q9H3W5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRN3Q9H3W5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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