Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPR88Q9GZN0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms