Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXQ1Q9C009 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXQ1Q9C009 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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