Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
REPIN1Q9BWE0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms