Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms