Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms