Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIKE1Q9BRV8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIKE1Q9BRV8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms