Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms