Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms