Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms