Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms