Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAT1Q99536 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VAT1Q99536 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms