Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms