Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms