Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms