Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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