Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85AQ96PX6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms