Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms