Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP3Q96P20 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms