Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms