Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CMTM3Q96MX0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CMTM3Q96MX0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CMTM3Q96MX0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CMTM3Q96MX0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CMTM3Q96MX0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CMTM3Q96MX0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CMTM3Q96MX0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CMTM3Q96MX0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CMTM3Q96MX0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CMTM3Q96MX0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms