Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms