Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX27Q96L92 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX27Q96L92 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms