Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLPTM1LQ96KA5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPTM1LQ96KA5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms