Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC41A2Q96JW4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC41A2Q96JW4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms