Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUCLG2Q96I99 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUCLG2Q96I99 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUCLG2Q96I99 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUCLG2Q96I99 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUCLG2Q96I99 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUCLG2Q96I99 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUCLG2Q96I99 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUCLG2Q96I99 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUCLG2Q96I99 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUCLG2Q96I99 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUCLG2Q96I99 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms