Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDCA7LQ96GN5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDCA7LQ96GN5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms