Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSUN4Q96CB9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
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