Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTSSAQ969W0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms